Im Zuge der Alpenbildung wurden grosse Bereiche zusammengedrückt, ein Meeresbecken ausgequetscht und Gesteinspakete übereinander geschoben und aufgestapelt. Das helvetische Gesteinspaket nördlich von Thuner- und Brienzersee dürfte dabei eine Distanz von rund 50 Kilometer zurückgelegt haben. Heute bildet dieses mit den Gebirgsketten Sibe Hängste – Hohgant und Sigriswilgrat das prägende Element des nördlichen Alpenrands. Es besteht aus 145–35 Millionen Jahre alten marinen Kalken, Mergeln und Sandsteinen. Die ursprüngliche Unterlage dieses Gesteinspakets befindet sich heute südöstlich des Brienzersees mit entsprechend älteren, 185–145 Millionen Jahre alten, marinen Kalken, Mergeln und Tonsteinen. Im Vorfeld der Alpen entwickelte sich eine Senke (Molassebecken). Diese füllte sich im Laufe der Zeit mit Abtragungsschutt aus den Alpen. In der späten Phase der Alpenbildung wurde der Südrand des Molassebeckens ebenfalls von der Gebirgsbildung betroffen und die Gesteinsschichten steilgestellt. Dieser als Subalpine Molasse bezeichnet Teil macht mit 27–23 Millionen Jahr alten Sandstein- und Nagelfluhbänken das Eriz aus.

Im jüngsten Abschnitt des Erdzeitalters wurde die Oberfläche durch Gletscher und Schmelzwasserbäche modelliert. Zahlreiche Moränen und Findlinge zeugen von dieser Zeit. Im ehemaligen Becken des Aaregletschers entwickelte sich ein grosser See, der im Laufe der Zeit durch Schutt der Lütschine und des Lombachs in zwei Becken gegliedert wurde und so zum heutigen Landschaftsbild mit Thuner- und Brienzersee führte. Aber auch im Untergrund verbirgt sich eine vielfältige Landschaft. In den mächtigen Kalkabfolgen entstand mit den St. Beatus-Höhlen eines der bedeutendsten Höhlensysteme der Welt.

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